许多客户的业务流程跨越了应用程序的界限，例如，吸纳新客户的流程始于使用CRM系统处理成功的销售机会或订单，但是这个程序很快就进入到会计程序，在此过程中建立新客户的记录，启动订单执行，以及准备发票，对于服务企业来说，可能需要在企业项目管理应用程序中创建已售出的项目和客户信息。

  如果没有应用程序集成，这些流程在跨越应用程序界限的时候可能就会出现延迟、冗余、数据录入错误和信息不完整，来自一个应用程序的信息必须手工重新录入另一个应用程序中，一个部门的操作或活动必须通过电子邮件、电话或者会议传达给其他部门。

  应用程序集成使得应用程序之间的这些交互可以通过编程实现，由应用程序事件触发，无需用户介入，当某公司在CRM软件的状态由“潜在客户”改变为“客户”时，这位客户的信息就会自动传递给会计程序，并创建相应的客户记录。

  会计团队可能还会收到一份自动发送的电子邮件，提醒他们注意这些事件，如果赢得了一个服务类型的销售机会，CRM中的事件会在企业项目管理应用程序中触发创建客户和项目记录，这样交付团队就可以计划提供服务了。

  还有一种用来自动化业务流程的集成形式，另一种应用程序的用户界面中的某个元素被嵌入到CRM应用程序中，这样，在流程中某个特定的时刻，CRM用户可以快速的手动输入数据或者从CRM应用程序内部启动另一个应用程序，如果信息输入另一个应用程序的方式必须经过用户的监督或者判断，这样的方法就十分有用。